Coding

Part:BBa_K4091024:Design

Designed by: Ana Paula Contelli Xavier, Gabriel Kimijima Itaziki, Fabio Nigro Hoffman Leal, Jean Lucas Ribeiro.   Group: iGEM21_USP-EEL-Brazil   (2021-10-20)


Myotoxic Phospholipase A2 from Bothrops jararaca


Assembly Compatibility:
  • 10
    INCOMPATIBLE WITH RFC[10]
    Illegal EcoRI site found at 1
    Illegal XbaI site found at 7
    Illegal SpeI site found at 484
    Illegal PstI site found at 490
  • 12
    INCOMPATIBLE WITH RFC[12]
    Illegal EcoRI site found at 1
    Illegal SpeI site found at 484
    Illegal PstI site found at 490
  • 21
    INCOMPATIBLE WITH RFC[21]
    Illegal EcoRI site found at 1
  • 23
    INCOMPATIBLE WITH RFC[23]
    Illegal EcoRI site found at 1
    Illegal XbaI site found at 7
    Illegal SpeI site found at 484
    Illegal PstI site found at 490
  • 25
    INCOMPATIBLE WITH RFC[25]
    Illegal EcoRI site found at 1
    Illegal XbaI site found at 7
    Illegal SpeI site found at 484
    Illegal PstI site found at 490
  • 1000
    COMPATIBLE WITH RFC[1000]


Design Notes

This sequence belongs to a eukaryotic organism and had a signal peptide that was removed once the design was thought to be used in E. coli. To facilitate purification of the protein His-TAG and TEV-Site were added.


Source

Genomic Sequence from Bothrops jararaca

References

COSTA, Kellen Cristina Torres. AVALIAÇÃO DOS EFEITOS SISTÊMICOS INDUZIDOS POR UMA FOSFOLIPASE A2 ISOLADA DA PEÇONHA DA SERPENTE Bothrops moojeni. 2017. 56 f. - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2017.

MAGALHÃES, A. Regina. Caracterização de enzimas em peçonhas animais: identificação de fosfolipases do escorpião Hadrurus gerstchi e atividades enzimáticas da arraia Potamotrygon falkneri. 2017. 97 f. Universidade de Brasília, Brasília, 2017

SANTOS-FILHO, Norival Alves. Caracterização Funcional e Estrutural de uma Fosfolipase A2 Ácida Tóxica Isolada da Peçonha de Bothrops moojeni. Universidade de São Paulo, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, São Paulo, 2017

SILVA, Caroline SERINO. Purificação e caracterização do primeiro inibidor de fosfolipases A2 do tipo gama presente no soro da serpente Bothrops jararaca. 2017. 62 f. Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017.